项目成果科普性介绍

国家自然科学基金地区科学基金项目(31860292)：基于单细胞测序及限时饲喂研究骨髓生物钟及概日节律

为了对小鼠昼夜节律进行监测，仿制了COMPASS¹⁾²⁾³⁾系统，根据国内零件供应情况进行了一些改造，关键组成部分如下表：

电路板	Main Unit	顶视图： 底视图：	由广西医科大学林伟龙老师进行了重新设计，可由嘉立创生产
	RIP Unit	顶视图： 底视图：
XH2.54-4P双头端子线		(图片引自淘宝网) 参考文献中用的是网线，这里改成了端子线，用于连接感应器电路板及UNO电路板	可在淘宝购买或定制
UNO R3开发板		(图片引自淘宝网) UNO R3开发板 ATmega328P单片机改进版	可在淘宝购买
PIR运动传感器(松下AMN32111)		(图片引自淘宝网)	这些元件与原文献一致，可在淘宝购买
光敏电阻		NSL-19M51【PHOTOCELL】
电阻等元件		1k欧姆、10k欧姆电阻等常备零件	更多细节可联系我们共同学习
电脑		通过USB接口连接UNO单片机，收集及存储数据
USB分线器		每个UNO板对应6个检测通道，USB分线器将多个UNO板接到同一台电脑，从而同时对多个通道进行数据收集
UPS电源		电压不稳定或者会有断电情况的时候建议加个UPS电源，避免由断电引起的检测中断
尼龙柱与尼龙螺帽等		用于将感应器固定到鼠笼上

测试及使用场景如下：

尚未发表，敬请后会。

项目执行过程中用到如下一些工具，在课题组建设过程中结合其他教学实践初步形成了一些教程(点击绿色字符可访问链接)：
1. 服务器使用：基于GNU/Linux操作系统搭建了分析平台，计算节点为一台戴尔T640服务器，登录节点为一台电脑，课题组成员可远程链接使用；
2. Linux&Shell：数据处理及初步分析在Linux命令行进行；
3. AWK：AWK在Linux命令行下可以非常方便地用于fasta、gtf等文件的简单处理；
4. R语言：数据深入分析及可视化基于R语言；

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